施肥应施于根集中分布层，即施到枝条外延20~40厘米处。大叶黄杨小毛球结合扩穴扩沟，采用环状沟或条状沟施，每年向外扩展。

施肥的时候要与土壤混合，使土与土相融，要均匀地上下施肥。根据研究，地下部分有1/4根在适宜条件下生长良好、功能强大，可满足地上3/4养分需求。因此，需要在地下部分创造至少1/3良好的根系环境，这1/3以上的根系环境必须位于根系集中分布层，且土壤肥沃。

太集中或分散的肥料都难以创造出适合根系的适宜区，达不到理想的施肥效果，甚至造成肥害，严重影响树体的生长。